Поскольку ваше учреждение является правопреемником, к нему переходят все права и обязанности. С юридической точки зрения новые документы, если не требуется изменения в условия соглашений, оформлять не нужно, можно внести изменения в сведения о сторонах в виде дополнения к договору.