Здравствуйте.
Действительно, юридическое лицо или ИП может находиться на нескольких режимах налогообложения одновременно.
Это можно использовать в частности когда ИП занимается одновременно несколькими видами разной деятельности.
Например, возможно совмещение ЕНВД с УСН или ОСНО.
В этом случае налогоплательщики "обязаны вести раздельный учет имущества, обязательств и хозяйственных операций" (пункт 7 статьи 346.26 НК РФ).
Учёт нужно вести так, чтобы показатели, нужные для расчёта одного из налогов были отделены от других показателей.