Здравствуйте.
Если вы опасаетесь что-то сделать "не так", то можете обратиться в одну из специализированных компаний, которые помогут зарегистрировать ООО. Учитывая то, что, как правило, они такие операции производят чуть ли не пачками, опыт есть - и немалый (хотя, конечно, ошибки бывают и в этом случае).
Цена таких услуг - около 2 500 рублей "под ключ", если участник один (если два и более - дороже).
Если же вы всё-таки хотите зарегистрировать ООО самостоятельно, то следует обратить внимание на типовые ошибки - казалось бы, мелкие, но из-за них будет получен отказ.
Подписав Устав и учредительный договор иной раз люди забывают прошить эти документы как положено. Бывает, что в документах не хватает даты проведения общего собрания, а также дату принятия решения об учреждении ООО.
На устав и договор иногда сразу ставят печать. Это недопустимо до момента государственной регистрации ООО. Ну и бывает, что в регистрирующий орган подают только оригиналы документов, тогда как нужны и копии.