Здравствуйте.
Данный вопрос регулируется пунктом 4 статьи 75 НК РФ.
"4. Пеня за каждый день просрочки определяется в процентах от неуплаченной суммы налога или сбора.
Процентная ставка пени принимается равной одной трехсотой действующей в это время ставки рефинансирования Центрального банка Российской Федерации."
Ограничения по размеру пени применительно к размеру самого образовавшегося долга НК РФ не содержит.