Кармен, Здравствуйте. В данном случае речь идет о так называемой налоговой недоимке. В таких случаях налоговый орган редко обращает внимание на свою ошибку и требует уплаты налога со всеми пенями и штрафами, хотя налицо плохое взаимодействие ФНС и ГИБДД. Но виновным в этом остается всегда плательщик. В ФНС вам скажут, что вы должны были лично поинтересоваться, почему вам не приходят уведомления об уплате транспортного налога, и будут отчасти правы. В любом случае, перерасчет на добровольных началах произведен не будет, и вас скорее всего ожидает суд. Именно там вам и следует доказывать свою правоту.