Здравствуйте, Кухтан.
Такие работы как достройка второго этажа вы не имеете право проводить без получения соответствующего разрешения согласно ст. 51 Градостроительного кодекса РФ. Без такого документа незаконный этаж может быть признан самовольной постройкой (в судебном порядке) и снесён.
Начинать нужно с подготовки проекта второго этажа и согласования его. Далее, после строительства, нужно получить технический план, кадастровый паспорт - и можно регистрировать право собственности в Росреестре.