Письмо, как неотъемлемая часть договора

#1
Уважаемые юристы, подскажите пожалуйста.
Между организациями А и Б заключен договор.
На протяжение месяца, между двумя компаниями велась деловая переписка, влияющая на условия договора и его выполнение.
Скажите может ли письмо/извещение/уведомление стать неотъемлемой частью договора и юридически на него повлиять?
 
#2
если в договоре указано, что он изменяется путем составления доп соглашений- то только соглашениями вы вправе изменять условия первоначального договора (соглашения), а не письмами, с другой стороны ООО, отказывается от своих доводов написанных в письме? в чем проблема?