Здравствуйте.
Насколько я знаю, действующим законодательством не установлен какой-либо чёткий срок, в течение которого обязательно нужно подать в налоговый орган заявление по указанной вами форме Р12001.
Главное требование - соблюдение минимального срока (у вас это уже есть) в два месяца и обязательная двукратная публикация сообщения в журнале "Вестник государственной регистрации"
А сама процедура реорганизации может продолжаться довольно долго - многие месяцы, ведь бывает, что быстро всё не сделать.