Klukva, необходимо обратиться в суд о признании свидетельства о праве на наследство выданное матери вашего отца, недействительным, поскольку она имела право наследовать только 1/2 долю наследства, а оставшаяся 1/2 доли должна была наследоваться вами. При этом просить суд признать за вами право собственности на эту 1/2 доли.
Одновременно вам будет необходимо приобщить к иску заявление в суд о восстановлении пропущенного процессуального срока (3 года) на признание недействительным свидетельства о праве на наследство, поскольку этот срок вы пропустили по уважительным причинам (не знали о приватизации квартиры). При этом необходимо иметь ввиду, что с момента, когда вВы об этом узнали, и до момента обращения в суд, не должно пройти более 3 лет. Все это естественно необходимо подтвердить суду доказательствами (письменными или свидетельскими).