Пинчук Виктория, Здравствуйте. В течение срока рассмотрения вашего заявления в ФНС будут проверять вас также и на наличие задолженности. Т.е. если таковая имеется, то сумма излишне уплаченного НДФЛ пойдет на погашение долга. Но даже если вы в курсе того, что у вас есть долг, все равно должны подавать заявление на возврат, для того, чтобы данная сумма не "затерялась" в налоговой системе. Перекрывать долг излишне уплаченным НДФЛ без вашего заявления никто не будет.