Aleks44, Добрый день. Пени и неустойка могут быть взысканы в вашем случае, только после предъявления соответствующего уведомления должнику и только в новом судебном производстве.
Т.е. направляете организации уведомление, после чего каждый день просрочки будет начисляться по 0,5-1% от общей суммы долга.