Регулирование договорных отношений с Украиной

Ранее был заключен договор с стороной на территории Украина. По состоянию на сегодня, договор по возврату денег украинская сторона не произвела. При изучении контракта нашлись пункты разногласий украинского и российского законодательства.

Что делать, если украинский суд не видит оснований принять наш иск? Есть ли другие механизмы взыскания долга?

А что написано у вас в договоре по поводу разрешения споров?
Есть вариант обратиться в Международный коммерческий арбитражный суд при Торгово-Промышленной Палате (такой есть и на Украине, и в России) - собственно, он и создан для подобных споров.

Если хозяйственный суд 1-й инстанции не хочет рассматривать иск, подавайте апелляционную жалобу на определение об отказе в принятии иска в порядке 91-94 статей хозяйственного процессуального кодекса Украины.